Esinduse eesmärgid on Euroopa Liidu institutsioonides Eesti omavalitsusliitude ja kohalike omavalitsuste ühishuvide esindamine, Euroopa Liidu poliitikate mõjutamine Eesti omavalitsusi puudutavates valdkondades, vahetu informatsiooni saamine nii Euroopa Liidu institutsioonide ettepanekutest kui ka algatustest ning informatsiooni vahetamine teiste Brüsselis asuvate omavalitsusliitude esindustega.